Фильтрация данных.строки фрейма по логическому условию

Question

Фильтрация данных.строки фрейма по логическому условию

Я хочу, чтобы отфильтровать строки data.frame на основе логического условия. Предположим, что у меня есть фрейм данных, как

   expr_value     cell_type

1    5.345618 bj fibroblast

2    5.195871 bj fibroblast

3    5.247274 bj fibroblast

4    5.929771          hesc

5    5.873096          hesc

6    5.665857          hesc

7    6.791656          hips

8    7.133673          hips

9    7.574058          hips

10   7.208041          hips

11   7.402100          hips

12   7.167792          hips

13   7.156971          hips

14   7.197543          hips

15   7.035404          hips

16   7.269474          hips

17   6.715059          hips

18   7.434339          hips

19   6.997586          hips

20   7.619770          hips

21   7.490749          hips

Я хочу получить новый фрейм данных, который выглядит одинаково, но имеет только данные для одного типа cell_type. Например, подмножество / выберите строки, которые содержат тип ячейки "hesc":

   expr_value     cell_type

1    5.929771          hesc

2    5.873096          hesc

3    5.665857          hesc

или либо тип клеток "BJ фибробласт" или "hesc":

   expr_value     cell_type

1    5.345618 bj fibroblast

2    5.195871 bj fibroblast

3    5.247274 bj fibroblast

4    5.929771          hesc

5    5.873096          hesc

6    5.665857          hesc

есть ли простой способ сделать это?

у меня есть пробовал:

expr[expr[2] == 'hesc']

# [1] "5.929771" "5.873096" "5.665857" "hesc"     "hesc"     "hesc"

если исходный фрейм данных называется "expr", но он дает результаты в неправильном формате, как вы можете видеть.

559 7

r dataframe

7 ответов:

Comments

Ничего не найдено.

learnr · Accepted Answer · 2009-11-06 12:08:47

expr[expr$cell_type == "hesc", ]

expr[expr$cell_type %in% c("hesc", "bj fibroblast"), ]

rcs · Accepted Answer · 2016-06-25 09:33:21

использовать subset (для интерактивного использования)
subset(expr, cell_type == "hesc")
subset(expr, cell_type %in% c("bj fibroblast", "hesc"))
или лучше dplyr::filter()
filter(expr, cell_type %in% c("bj fibroblast", "hesc"))

Ken Williams · Accepted Answer · 2009-11-09 19:35:10

причина expr[expr[2] == 'hesc'] не работает это для фрейма данных,x[y] выбирает столбцы, а не строки. Если вы хотите выбрать строки, измените синтаксис x[y,] вместо:
> expr[expr[2] == 'hesc',]
  expr_value cell_type
4   5.929771      hesc
5   5.873096      hesc
6   5.665857      hesc

nathaneastwood · Accepted Answer · 2014-09-04 16:12:25

вы могли бы использовать dplyr пакет:
library(dplyr)
filter(expr, cell_type == "hesc")
filter(expr, cell_type == "hesc" | cell_type == "bj fibroblast")

Daniel Bonetti · Accepted Answer · 2017-08-10 17:16:52

иногда столбец, который вы хотите отфильтровать, может отображаться в другой позиции, чем индекс столбца 2, или иметь имя переменной.

в этом случае, вы можете просто передать имя столбца вы хотите отфильтровать как:
columnNameToFilter = "cell_type"
expr[expr[[columnNameToFilter]] == "hesc", ]

christopher van hoecke · Accepted Answer · 2018-07-18 18:14:13

никто, кажется, не включенными в которой функции. Он также может оказаться полезным для фильтрации.
expr[which(expr$cell == 'hesc'),]
Это также будет обрабатывать NAs и отбрасывать их из результирующего фрейма данных.

запуск этого на 9840 на 24 кадра данных 50000 раз, похоже, что метод which имеет 60% более быстрое время выполнения, чем метод% in%.

Justin Harbour · Accepted Answer · 2018-07-07 00:46:29

Я работал над фреймом данных и не имел удачи с предоставленными ответами, он всегда возвращал 0 строк, поэтому я нашел и использовал grepl:
df = df[grepl("downlink",df$Transmit.direction),]
который в основном обрезал мой фрейм данных только для строк, содержащих "нисходящую ссылку" в столбце направления передачи. P. S. Если кто-нибудь может догадаться, почему я не вижу ожидаемое поведение, пожалуйста, оставьте комментарий.

конкретно к исходному вопросу:
expr[grepl("hesc",expr$cell_type),]

expr[grepl("bj fibroblast|hesc",expr$cell_type),]