Как добавить строку заголовка в фрейм данных pandas

Question

Как добавить строку заголовка в фрейм данных pandas

Я читаю CSV-файл в pandas. Этот csv-файл состоит из четырех столбцов и некоторых строк, но не имеет строки заголовка, которую я хочу добавить. Я пробовал следующее:

Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='t')

Frame=pd.DataFrame([Cov], columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"])

Frame.to_csv("path/to/file.txt", sep='t')

но когда я применяю код, я получаю следующую ошибку:

ValueError: Shape of passed values is (1, 1), indices imply (4, 1)

что именно означает ошибка? И что было бы чистым способом в python добавить строку заголовка в мой csv-файл/pandas df?

605 4

python pandas header csv

4 ответов:

Comments

Ничего не найдено.

Leb · Accepted Answer · 2016-06-08 13:08:52

можно использовать names непосредственно в read_csv

имена: массив-как, по умолчанию нет списка имен столбцов для использования. Если файл не содержит строки заголовка, то вы должны явно передать header=None
Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='\t', 
                  names = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"])
строка ниже не будет работать, как вы ожидаете. Cov уже является фреймом данных, предполагая, что он действительно имеет 4 столбца, когда он читается из файла.
Frame=pd.DataFrame([Cov], columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"])

Anton Protopopov · Accepted Answer · 2016-03-25 23:55:48

В качестве альтернативы вы можете прочитать вам csv с header=None и затем добавить его с df.columns:
Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='\t', header=None)
Cov.columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"]

Bhardwaj Joshi · Accepted Answer · 2018-02-05 07:37:01

col_Names=["Sequence", "Start", "End", "Coverage"]
my_CSV_File= pd.read_csv("yourCSVFile.csv",names=col_Names)
сделав это, просто проверьте его с[ну, очевидно, я знаю, вы знаете, что. Но все же...
my_CSV_File.head()
надеюсь, что это помогает ... Ура

romulomadu · Accepted Answer · 2018-02-05 08:35:45

чтобы исправить свой код, вы можете просто изменить [Cov] to Cov.values первый параметр pd.DataFrame станет многомерной numpy время:
Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='\t')
Frame=pd.DataFrame(Cov.values, columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"])
Frame.to_csv("path/to/file.txt", sep='\t')
но самое умное решение по-прежнему является использование pd.read_excel С header=None и names=columns_list.