Использование csvreader против gzipped файла в Python



У меня есть куча gzipped CSV файлов, которые я хотел бы открыть для проверки с помощью встроенного в Python CSV reader. Я хотел бы сделать это без необходимости сначала вручную распаковать их на диск. Я думаю, что хочу каким-то образом получить поток несжатых данных и передать его в CSV-считыватель. Возможно ли это в Python?

607   3  

3 ответов:

Используйте модуль gzip:

with gzip.open(filename) as f:
    reader = csv.reader(f)
    #...

Я пробовал вышеописанную версию для записи и чтения, и она не работала в Python 3.3 из-за ошибки" байт". Однако после некоторых проб и ошибок я смог получить следующее, чтобы работать. Может быть, это также помогает другим:

import csv
import gzip
import io


with gzip.open("test.gz", "w") as file:
    writer = csv.writer(io.TextIOWrapper(file, newline="", write_through=True))
    writer.writerow([1, 2, 3])
    writer.writerow([4, 5, 6])

with gzip.open("test.gz", "r") as file:
    reader = csv.reader(io.TextIOWrapper(file, newline=""))
    print(list(reader))

Как и предполагает амохр, работает также следующее:

import gzip, csv

with gzip.open("test.gz", "wt", newline="") as file:
    writer = csv.writer(file)
    writer.writerow([1, 2, 3])
    writer.writerow([4, 5, 6])

with gzip.open("test.gz", "rt", newline="") as file:
    reader = csv.reader(file)
    print(list(reader))

Более полное решение:

import csv, gzip
class GZipCSVReader:
    def __init__(self, filename):
        self.gzfile = gzip.open(filename)
        self.reader = csv.DictReader(self.gzfile)
    def next(self):
        return self.reader.next()
    def close(self):
        self.gzfile.close()
    def __iter__(self):
        return self.reader.__iter__()

Теперь вы можете использовать его следующим образом:

r = GZipCSVReader('my.csv')
for map in r:
    for k,v in map:
        print k,v
r.close()

EDIT: следуя приведенному ниже комментарию, как насчет более простого подхода:

def gzipped_csv(filename):
    with gzip.open(filename) as f:
        r = csv.DictReader(f)
        for row in r:
            yield row

Который давайте вы тогда

for row in gzipped_csv(filename):
    for k, v in row:
        print(k, v)

Comments

    Ничего не найдено.