Сохранение массива Numpy в виде изображения



У меня есть матрица в виде массива Numpy. Как бы я записал его на диск в виде образа? Работает любой формат (png, jpeg, bmp...). Одним из важных ограничений является то, что PIL нет.

836   16  

16 ответов:

можно использовать PyPNG. Это чистый Python (без зависимостей) с открытым исходным кодом PNG-кодер / декодер, и это поддерживает запись массивов NumPy в виде изображений.

Это использует PIL, но, возможно, некоторые могут найти его полезным:

import scipy.misc
scipy.misc.imsave('outfile.jpg', image_array)

EDIT: текущая scipy версия начала нормализовать все изображения, чтобы min(данные) стали черными, а max (данные) стали белыми. Это нежелательно, если данные должны быть точными серыми уровнями или точными каналами RGB. Решение:

import scipy.misc
scipy.misc.toimage(image_array, cmin=0.0, cmax=...).save('outfile.jpg')

ответ пил (на всякий случай это полезно).

учитывая массив numpy "A":

from PIL import Image
im = Image.fromarray(A)
im.save("your_file.jpeg")

вы можете заменить "jpeg" практически любым форматом, который вы хотите. Подробнее о форматах здесь

Pure Python (2 & 3), фрагмент без сторонних зависимостей.

эта функция записывает сжатый, истинный цвет (4 байта на пиксель) RGBA PNG.

def write_png(buf, width, height):
    """ buf: must be bytes or a bytearray in Python3.x,
        a regular string in Python2.x.
    """
    import zlib, struct

    # reverse the vertical line order and add null bytes at the start
    width_byte_4 = width * 4
    raw_data = b''.join(
        b'\x00' + buf[span:span + width_byte_4]
        for span in range((height - 1) * width_byte_4, -1, - width_byte_4)
    )

    def png_pack(png_tag, data):
        chunk_head = png_tag + data
        return (struct.pack("!I", len(data)) +
                chunk_head +
                struct.pack("!I", 0xFFFFFFFF & zlib.crc32(chunk_head)))

    return b''.join([
        b'\x89PNG\r\n\x1a\n',
        png_pack(b'IHDR', struct.pack("!2I5B", width, height, 8, 6, 0, 0, 0)),
        png_pack(b'IDAT', zlib.compress(raw_data, 9)),
        png_pack(b'IEND', b'')])

... Данные должны быть записаны непосредственно в файл, открытый как двоичный, например:

data = write_png(buf, 64, 64)
with open("my_image.png", 'wb') as fd:
    fd.write(data)

С matplotlib:

import matplotlib

matplotlib.image.imsave('name.png', array)

работает с matplotlib 1.3.1, я не знаю о более низкой версии. Из строки документа:

Arguments:
  *fname*:
    A string containing a path to a filename, or a Python file-like object.
    If *format* is *None* and *fname* is a string, the output
    format is deduced from the extension of the filename.
  *arr*:
    An MxN (luminance), MxNx3 (RGB) or MxNx4 (RGBA) array.

enter image description here

Если у вас есть matplotlib, вы можете сделать:

import matplotlib.pyplot as plt
plt.imshow(matrix) #Needs to be in row,col order
plt.savefig(filename)

это сохранит сюжет (а не сами изображения). enter image description here

здесь opencv для python (http://docs.opencv.org/trunk/doc/py_tutorials/py_tutorials.html).

import cv2
import numpy as np

cv2.imwrite("filename.png", np.zeros((10,10)))

полезно, если вам нужно сделать больше обработки, кроме спасения.

добавление к ответу @ideasman42:

def saveAsPNG(array, filename):
    import struct
    if any([len(row) != len(array[0]) for row in array]):
        raise ValueError, "Array should have elements of equal size"

                                #First row becomes top row of image.
    flat = []; map(flat.extend, reversed(array))
                                 #Big-endian, unsigned 32-byte integer.
    buf = b''.join([struct.pack('>I', ((0xffFFff & i32)<<8)|(i32>>24) )
                    for i32 in flat])   #Rotate from ARGB to RGBA.

    data = write_png(buf, len(array[0]), len(array))
    f = open(filename, 'wb')
    f.write(data)
    f.close()

так что вы можете сделать:

saveAsPNG([[0xffFF0000, 0xffFFFF00],
           [0xff00aa77, 0xff333333]], 'test_grid.png')

производства test_grid.png:

Grid of red, yellow, dark-aqua, grey

(прозрачность также работает, уменьшая старший байт от 0xff.)

вы можете использовать библиотеку 'skimage' в Python

пример:

from skimage.io import imsave
imsave('Path_to_your_folder/File_name.jpg',your_array)

matplotlib svn имеет новую функцию для сохранения изображений как просто изображение - без осей и т. д. это очень простая функция для резервного копирования, если вы не хотите устанавливать svn (скопированный прямо из image.py в matplotlib svn удалена строка документа для краткости):

def imsave(fname, arr, vmin=None, vmax=None, cmap=None, format=None, origin=None):
    from matplotlib.backends.backend_agg import FigureCanvasAgg as FigureCanvas
    from matplotlib.figure import Figure

    fig = Figure(figsize=arr.shape[::-1], dpi=1, frameon=False)
    canvas = FigureCanvas(fig)
    fig.figimage(arr, cmap=cmap, vmin=vmin, vmax=vmax, origin=origin)
    fig.savefig(fname, dpi=1, format=format)

миру, вероятно, не нужен еще один пакет для записи массива numpy в файл PNG, но для тех, кто не может получить достаточно, я недавно поставил numpngw на github:

https://github.com/WarrenWeckesser/numpngw

и на pypi: https://pypi.python.org/pypi/numpngw/

единственная внешняя зависимость-numpy.

вот первый пример от examples каталог репозитория. Этот существенная линия просто

write_png('example1.png', img)

здесь img - это массив numpy. Весь код перед этой строкой-это операторы импорта и код для создания img.

import numpy as np
from numpngw import write_png


# Example 1
#
# Create an 8-bit RGB image.

img = np.zeros((80, 128, 3), dtype=np.uint8)

grad = np.linspace(0, 255, img.shape[1])

img[:16, :, :] = 127
img[16:32, :, 0] = grad
img[32:48, :, 1] = grad[::-1]
img[48:64, :, 2] = grad
img[64:, :, :] = 127

write_png('example1.png', img)

вот файл PNG, который он создает:

example1.png

предполагая, что вы хотите получить изображение в оттенках серого:

im = Image.new('L', (width, height))
im.putdata(an_array.flatten().tolist())
im.save("image.tiff")

Если вам случится, чтобы использовать уже [Пы]Qt, вы можете быть заинтересованы в qimage2ndarray. Начиная с версии 1.4 (только что выпустили), PySide также поддерживается, и будет маленькая imsave(filename, array) функции, схожие с scipy, но с использованием Qt, а не пил. С 1.3, просто используйте что-то вроде следующего:

qImage = array2qimage(image, normalize = False) # create QImage from ndarray
success = qImage.save(filename) # use Qt's image IO functions for saving PNG/JPG/..

(еще одним преимуществом 1.4 является то, что это чистое решение python, что делает его еще более легким.)

Если вы работаете в среде python Spyder, то это не может быть проще, чем просто щелкнуть правой кнопкой мыши массив в обозревателе переменных, а затем выбрать опцию Показать изображение.

enter image description here

Это попросит вас сохранить изображение в dsik, в основном в формате PNG.

библиотека PIL в этом случае не понадобится.

scipy.misc дает предупреждение об устареванииimsave функция и предлагает использование .

import imageio
imageio.imwrite('image_name.png', img)

использовать cv2.imwrite.

import cv2
assert mat.shape[2] == 1 or mat.shape[2] == 3, 'the third dim should be channel'
cv2.imwrite(path, mat) # note the form of data should be height - width - channel  

Comments

    Ничего не найдено.