Точечные графики в панд / Pyplot: как построить по категориям
Я пытаюсь сделать простой график рассеяния в pyplot, используя объект Pandas DataFrame, но хочу эффективный способ построения двух переменных, но символы диктуются третьим столбцом (ключом). Я пробовал различные способы, используя df.groupby, но не успешно. Ниже приведен пример сценария df. Это окрашивает маркеры в соответствии с "key1", но Id хотел бы видеть легенду с категориями "key1". Я близко? Спасибо.
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
df = pd.DataFrame(np.random.normal(10,1,30).reshape(10,3), index = pd.date_range('2010-01-01', freq = 'M', periods = 10), columns = ('one', 'two', 'three'))
df['key1'] = (4,4,4,6,6,6,8,8,8,8)
fig1 = plt.figure(1)
ax1 = fig1.add_subplot(111)
ax1.scatter(df['one'], df['two'], marker = 'o', c = df['key1'], alpha = 0.8)
plt.show()
6 ответов:
можно использовать
scatterдля этого, но это требует наличия числовых значений для вашегоkey1, и у вас не будет легенды, как вы заметили.лучше использовать
plotдля дискретных категорий, как это. Например:import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import pandas as pd np.random.seed(1974) # Generate Data num = 20 x, y = np.random.random((2, num)) labels = np.random.choice(['a', 'b', 'c'], num) df = pd.DataFrame(dict(x=x, y=y, label=labels)) groups = df.groupby('label') # Plot fig, ax = plt.subplots() ax.margins(0.05) # Optional, just adds 5% padding to the autoscaling for name, group in groups: ax.plot(group.x, group.y, marker='o', linestyle='', ms=12, label=name) ax.legend() plt.show()
если вы хотите, чтобы все выглядело как по умолчанию
pandasстиль, а затем просто обновитьrcParamsс таблицей стилей панды и использовать его генератор цвета. (Я также настраиваю легенду слегка):import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import pandas as pd np.random.seed(1974) # Generate Data num = 20 x, y = np.random.random((2, num)) labels = np.random.choice(['a', 'b', 'c'], num) df = pd.DataFrame(dict(x=x, y=y, label=labels)) groups = df.groupby('label') # Plot plt.rcParams.update(pd.tools.plotting.mpl_stylesheet) colors = pd.tools.plotting._get_standard_colors(len(groups), color_type='random') fig, ax = plt.subplots() ax.set_color_cycle(colors) ax.margins(0.05) for name, group in groups: ax.plot(group.x, group.y, marker='o', linestyle='', ms=12, label=name) ax.legend(numpoints=1, loc='upper left') plt.show()
Это просто сделать с Seaborn (
pip install seaborn) как oneliner
sns.pairplot(x_vars=["one"], y_vars=["two"], data=df, hue="key1", size=5):import seaborn as sns import pandas as pd import numpy as np np.random.seed(1974) df = pd.DataFrame( np.random.normal(10, 1, 30).reshape(10, 3), index=pd.date_range('2010-01-01', freq='M', periods=10), columns=('one', 'two', 'three')) df['key1'] = (4, 4, 4, 6, 6, 6, 8, 8, 8, 8) sns.pairplot(x_vars=["one"], y_vars=["two"], data=df, hue="key1", size=5)вот фрейм данных для справки:
поскольку у вас есть три переменных столбцов ваших данных, вы можете построить все попарно размеры с:
sns.pairplot(vars=["one","two","three"], data=df, hue="key1", size=5)https://rasbt.github.io/mlxtend/user_guide/plotting/category_scatter/ - это еще один вариант.
С
plt.scatter, Я могу думать только об одном: использовать прокси-исполнителя:df = pd.DataFrame(np.random.normal(10,1,30).reshape(10,3), index = pd.date_range('2010-01-01', freq = 'M', periods = 10), columns = ('one', 'two', 'three')) df['key1'] = (4,4,4,6,6,6,8,8,8,8) fig1 = plt.figure(1) ax1 = fig1.add_subplot(111) x=ax1.scatter(df['one'], df['two'], marker = 'o', c = df['key1'], alpha = 0.8) ccm=x.get_cmap() circles=[Line2D(range(1), range(1), color='w', marker='o', markersize=10, markerfacecolor=item) for item in ccm((array([4,6,8])-4.0)/4)] leg = plt.legend(circles, ['4','6','8'], loc = "center left", bbox_to_anchor = (1, 0.5), numpoints = 1)в результате:
вы можете использовать df.сюжет.скаттер, и передать массив в C= аргумент, определяющий цвет каждой точки:
import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt df = pd.DataFrame(np.random.normal(10,1,30).reshape(10,3), index = pd.date_range('2010-01-01', freq = 'M', periods = 10), columns = ('one', 'two', 'three')) df['key1'] = (4,4,4,6,6,6,8,8,8,8) colors = np.where(df["key1"]==4,'r','-') colors[df["key1"]==6] = 'g' colors[df["key1"]==8] = 'b' print(colors) df.plot.scatter(x="one",y="two",c=colors) plt.show()
вы также можете попробовать Альтаир или ggpot которые ориентированы на декларативные визуализации.
import numpy as np import pandas as pd np.random.seed(1974) # Generate Data num = 20 x, y = np.random.random((2, num)) labels = np.random.choice(['a', 'b', 'c'], num) df = pd.DataFrame(dict(x=x, y=y, label=labels))Альтаир код
from altair import Chart c = Chart(df) c.mark_circle().encode(x='x', y='y', color='label')ggplot код
from ggplot import * ggplot(aes(x='x', y='y', color='label'), data=df) +\ geom_point(size=50) +\ theme_bw()
Это довольно hacky, но вы могли бы использовать
one1какFloat64Indexчтобы сделать все за один раз:df.set_index('one').sort_index().groupby('key1')['two'].plot(style='--o', legend=True)обратите внимание, что по состоянию на 0.20.3,сортировка индекса необходимо, а легенда немного шаткий.










Comments