snakemake- все статьи тега
Как выполнять простые строковые операции в выводе snakemake
Я создаю свой первый файл snakemake, и я дошел до того, что мне нужно выполнить простую строковую операцию над значением моего output, так что моя команда shell работает так, как ожидалось: rule sketch: input: 'out/genomes.txt' output: 'out/genomes.msh' shell: 'mash sketch -l {input} -k 31 -s 100000 -o {output}' Мне нужно применить функцию split к {output} так, чтобы использовалось только имя файла с расширением. Я не мог найти ничего в документах или в связанных с ними воп ...